miércoles, 13 de junio de 2018

Búsqueda de postulantes para presentarse a Becas Doctorales o Posdoctorales de CONICET

TEMA: Estudio de la relaciones estructura-función de flavoenzimas.

DIRECCIÓN: Dr. Eduardo A. Ceccarelli/Dra. Daniela Catalano Dupuy

LUGAR: Laboratorio de Estructura, Plegamiento y Función de Proteínas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario (IBR), CONICET-UNR. Ocampo y Esmeralda, Rosario

Resumen del Proyecto:

Nuestro grupo estudia dos grandes grupos de proteínas: los chaperones moleculares y las flavoenzimas, analizando las relaciones entre sus estructuras y funciones, como así también sus posibles inserciones metabólicas en determinados organismos. Estas proteínas se encuentran ampliamente distribuidas y cumplen funciones relevantes en procesos fisiológicos normales y durante condiciones de estrés en todos los organismos vivos.

Nos interesan especialmente aquellos procesos que le permiten a estas proteínas cumplir sus roles eficientemente: el reconocimiento de sustratos, la regulación de sus actividades por el entorno y/o por otras proteínas, su interacción con otras macromoléculas, sus mecanismos catalíticos y la obtención de altas eficiencias funcionales.

Nuestro acercamiento experimental incluye el estudio de enzimas recombinantes salvajes y modificadas por ingeniería genética. Utilizamos como modelos enzimas provenientes de arveja (Pisum sativum),  Escherichia coliLeptospira  interrogans , como así también de manera comparativa la de otras plantas y bacterias.

 Algunas referencias del grupo:

Catalano-Dupuy, D. L., Orecchia, M., Rial, D. V. and Ceccarelli, E. A. 2006. Reduction of the pea Ferredoxin-NADP(H) Reductase Catalytic Efficiency by the Structuring of a Carboxil-Terminal Artificial Metal Binding Site. Biochemistry. 45 , 13899-13909.

Nascimento, A.S.*, Catalano-Dupuy, D. L.*, Bernardes, A., de Oliveira Neto, M., Santos, M. A. M., Ceccarelli, E. A.and Polikarpov, I. 2007. Crystal Structures of Leptospira interrogans FAD-containing Ferredoxin-NADP+ reductase and its complex with NADP +. BMC Structural Biology. 7:69.M

Musumeci M. A., Arakaki, A. K., Rial, D. V., Catalano-Dupuy, D. L. and Ceccarelli, E. A. 2008. Modulation of the Ferredoxin-NADP(H) reductase enzymatic efficiency by the amino acid volume around the catalytic site. FEBS Journal. 275 (6):1350-1366.

Catalano-Dupuy, D. L., Musumeci M. A., López-Rivero, A. and Ceccarelli, E. A. (2011) A highly stable plastidic-type ferredoxin-NADP(H) reductase in the pathogenic bacterium Leptospira interrogans. PLoS ONE. 6(10):e26736. doi:10.1371/Journal.pone.0026736.

Catalano-Dupuy, D. L., López-Rivero, A., Soldano, A. and Ceccarelli, E. A. (2013). Redox Proteins as Targets for Drugs Development against Pathogens. Current Pharmaceutical Design. 19(14): 2594-605.

Soldano, A., Yao, H., Rivera, M., Ceccarelli, E. A. and Catalano-Dupuy, D. L. (2014). Heme-Iron Utilization by Leptospira interrogans Requires a Heme Oxygenase and a Plastidic-Type Ferredoxin-NADP+ Reductase. Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-General Subjects 1840(11): 3208–3217.

Soldano, A., Klinke, S., Otero, L. H., Rivera, M., Catalano-Dupuy, D. L. and Ceccarelli, E. A. (2017) Structural and mutational analysis of the Leptospira interrogans virulence-related heme oxygenase provide insights into its catalytic mechanism. PLoS ONE 12(8): e0182535 doi:10.1371/journal.pone.0182535).

 Más información en:

http://www.ibr-conicet.gov.ar/laboratorios/ceccarelli/

http://www.ibr-conicet.gov.ar/personal/catalano-dupuy-daniela-l

Perfil requerido:

Para Becas Doctorales: Licenciados en Biotecnología, Bioquímicos o carreras afines, preferentemente con conocimiento en Biología Molecular y Microbiología, y altamente motivados. Conocimientos de Inglés y disponibilidad para hacer estadías en el extranjero (no excluyente).

Para Becas Postdoctorales: Doctorado en Ciencias Biológicas o similar, finalizado o a finalizar antes del 31 de Marzo de 2019.

CONTACTO: Enviar CV a ceccarelli@ibr-conicet.gov.ar / catalano@ibr-conicet.gov.ar

 

 

  

lunes, 14 de mayo de 2018

Se buscan estudiantes avanzados para postular a la convocatoria de becas doctorales #CONICET

 se ofrece también la posibilidad de realizar pasantías y/o tesis de licenciatura

Proyecto: “Bacterias solubilizadoras de hierro y fosfato antagonistas de hongos fitopatógenos. Aplicación al desarrollo de bioformulaciones para mejorar la productividad y calidad de pasturas en la región pampeana”

Contacto: Fernando Pieckenstain, Nazareno Castagno
Lugar de Trabajo: Instituto Tecnológico de Chascomús (INTECH-CONICET-CIC).  Av. Intendente Marino Km 8,2. Chascomús, Bs As. Posibilidad de alojamiento gratuito en las residencias del Instituto.
El postulante se incorporará al grupo compuesto por los Laboratorios de Interacción Planta-Microorganismo y Microbiología del Suelo .
Resumen del Proyecto: aislamiento y caracterización de bacterias rizosféricas y endofitas de pasturas cultivadas en la región pampeana. Identificación de bacterias solubilizadoras de nutrientes y antagonistas de hongos patógenos.
El proyecto involucra el uso de técnicas de:
Microbiología
Biología molecular
taxonomía molecular de hongos y bacterias, transformación de bacterias, qRT-PCR
Bioquímica
cuantificación de metabolitos
Microscopía
epi-fluorescencia y confocal
Bioinformática
secuenciación masiva aplicada al estudio de comunidades microbianas, secuenciación de genomas, análisis estadístico.

Requisitos: estudiante avanzado de Biología, Biotecnología, Bioquímica, Microbiología o carreras afines, buen promedio y conocimientos de inglés. Enviar cv + analítico a pieckenstain@intech.gov.ar   o ncastagno@intech.gov.ar

Referencias en la temática
  • Rossi, FR, (...), Pieckenstain, FL, Carrillo, N. (2017). Plant Journal 92(5), pp. 761-773.
  • Romero, FM, Marina, M, Pieckenstain, F.L. (2016). Research in Microbiology 167(3), pp. 222-233.
  • Campestre, M.P., Castagno, L.N., Estrella, M.J., Ruiz, O.A. (2016). Journal of Plant Physiology 192, pp. 47-55.
  • Castagno, LN , (...), Mendoza, RE, Estrella, MJ. (2014). Plant and Soil 385(1-2), pp. 357-371.
  • Romero, FM, Marina, M, Pieckenstain, FL. (2014). FEMS Microbiology Letters 351(2), pp. 187-194.
  • Castagno, LN , Estrella, MJ, (...), Ruiz, OA. (2011). Journal of Applied Microbiology 110(5), pp. 1151-1165.
  

jueves, 10 de mayo de 2018

LLAMADO A BECARIOS DOCTORALES Y POSDOCTORALES CONICET 2018

LABORATORIO DE BIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR DE
LIPIDOS IBR CONICET

CONTACTO: Dra Claudia Banchio banchio@ibr-conicet.gov.ar
EXOSOMAS COMO BIOMARCADORES

Resumen:
El diagnóstico temprano del cáncer permite la rápida instauración del
tratamiento adecuado y específico y, de esta manera, mejora la
calidad de vida de los pacientes afectados. Para concretarse, es
necesaria la búsqueda e identificación de nuevos biomarcadores, es
decir, de indicadores del estado biológico de las células.
Los exosomas son pequeñas vesículas extracelulares que por sus
características aparecen como posibles candidatos a ser utilizados
como biomarcadores y, además, como herramientas terapéuticas. El
contenido de los exosomas cambia según el estado fisiológico de las
células; es decir, el número de copias y tipo de molécula varía según
la condición en la que las células se encuentren. En este sentido,
parece existir un perfil molecular, con una abundancia de lípidos,
proteínas y ARNs específicas para cada condición.
Considerando que en su aspecto más básico, las enfermedades
implican un cambio en el estado fisiológico que afecta sistémicamente
a diferentes grupos celulares, analizar comparativamente el contenido
vesicular de pacientes control (sin la enfermedad) y afectados, podría
determinar un perfil molecular diferencial para ambos casos, los que
podrían ser empleados para el diagnóstico diferencial de la
enfermedad, su seguimiento y evaluación de la eficacia terapéutica.
En otro escenario, y teniendo en cuenta que las células tumorales
liberan exosomas capaces de modificar el comportamiento de otros
tipos celulares y, de esa manera, el progreso y la metástasis del
tumor, los exosomas surgen como posibles blancos terapéuticos.

miércoles, 2 de mayo de 2018

Charla Debate en la Universidad de Cordoba

El Dr. Ceccarelli presentará su plataforma electoral para la elección
como candidato al Directorio de CONICET el dia 18 de mayo en el
auditorio de Odontología, ubicado en Avda. Haya de la Torre (S/N) de
ciudad Universitaria, CORDOBA, en el horario de 13 a 15 hs.

Posición doctoral en el Instituto Pasteur de Montevideo

http://bit.ly/2Ibl8Bq